Компания привлечена к административной ответственности по статье 14.31 КоАП РФ. УФАС провело сравнительный анализ тарифов эконом-класса на пассажирские воздушные перевозки авиакомпании "Сибирь" на маршруте "Новосибирск-Сочи" и тарифов эконом-класса ОАО "Владивосток Авиа" на сопоставимом расстоянии на маршруте "Новосибирск-Краснодар" в период с июня по сентябрь 2011 года. Было установлено, что на сходных маршрутах у "Сибири" тарифы выше, чем у ОАО "Владивосток Авиа": на 65% - на обычных тарифах, на 43% - на специальных. При себестоимости перевозки одного пассажира у "Сибири" по маршруту "Новосибирск-Сочи" на 9% выше, чем себестоимость перевозки одного пассажира "Владивосток Авиа" по маршруту "Новосибирск-Краснодар".
Антимонопольное ведомство признало, что такая разница в тарифах является злоупотреблением авиакомпании "Сибирь". В авиакомпании заявляли, что будут обжаловать решение ФАС.